抗生素对发酵中药饲料作用效果的影响，主要体现在对制剂中益生菌的杀灭作用。经过体外药敏实验验证，结果表明绝大多数抗生素对常见益生菌如芽孢杆菌、乳酸菌均具有很强的抑制作用。发酵中药的本质是利用益生菌的生物转化作用，对中药材进行加工炮制，的一种新型中药制剂，是以发酵型中药成分为主，同时含有益生菌、酶、维生素等物质中的一类或几类成分的复合物。

　　根据发酵中药饲料中成分种类的不同，可将其分为含活菌和无活菌两大类，因此，抗生素与发酵型中药在联合应用方面会出现协同和拮抗，并以协同为主的作用效果，主要原因是发酵中药中益生菌发挥作用所占比重较小，是否将含活菌类发酵中药与抗生素联合应用，可视病情而定。

　　例如，无活菌型发酵清热解毒类中药，在某些严重的细菌、病毒性疾病时，与抗生素联合应用效果较好;活菌型发酵中药则要根据病情的需要，在目标功能上做取舍，是选择抗菌、抗病毒、还是利用益生菌的改善肠道菌群平衡作用，视具体情况而定。