1 中毒因素
有的猪场长期饲喂发霉变质的健康饲料，饮用污染的水源，造成猪只发生霉玉米毒素中毒；或误食污染有农药、杀虫药、灭鼠药及化学药物的食源引发中毒。中毒发生后，猪肠道粘膜免疫系统与胃肠道的消化吸收机能均受到破坏，发酵中药饲料伤害猪肠道的健康，严重者造成死亡。
2 营养因素
给猪饲喂的健康饲料中营养不全，不均衡，质量低劣，造成机体营养缺乏，会直接影响到肠粘膜免疫系统的功能和胃肠道的健康。比如饲料中缺乏各种维生素与微量元素等，可引发胃肠道机能紊乱，进而影响到整个猪体的健康。缺乏VB，猪只表现厌食、消化不良、腹泻等；缺乏VD、钙与磷比例失调，可引发佝偻病、胃肠道机能下降，消化不良、食欲减退、发育停滞；缺乏VE与硒，可引发猪只消化道机能紊乱、食欲不振、呕吐、腹泻、便血以及营养应激等；缺铁可引发仔猪营养性贫血、食欲减退、周期性下痢与便秘；缺锌可引发猪只厌食、胃肠道机能紊乱，生长发育迟缓等。由此可见，营养缺乏与许多营养代谢病的发生，对猪只胃肠道的健康都会造成危害。